நாட் மெட் | ஒருங்கிணைந்த கட்டியை மேப்பிங் செய்வதற்கான பல-ஓமிக்ஸ் அணுகுமுறை

நாட் மெட் | பெருங்குடல் புற்றுநோயின் ஒருங்கிணைந்த கட்டி, நோயெதிர்ப்பு மற்றும் நுண்ணுயிர் நிலப்பரப்பை வரைபடமாக்குவதற்கான பல-ஓமிக்ஸ் அணுகுமுறை நோயெதிர்ப்பு மண்டலத்துடன் நுண்ணுயிரியின் தொடர்புகளை வெளிப்படுத்துகிறது
சமீபத்திய ஆண்டுகளில் முதன்மை பெருங்குடல் புற்றுநோய்க்கான பயோமார்க்ஸர்கள் விரிவாக ஆய்வு செய்யப்பட்டிருந்தாலும், தற்போதைய மருத்துவ வழிகாட்டுதல்கள் கட்டி-லிம்ப்ப் முனை-மெட்டாஸ்டாஸிஸ் ஸ்டேஜிங் மற்றும் டி.என்.ஏ பொருந்தாத பழுதுபார்ப்பு (எம்.எம்.ஆர்) குறைபாடுகள் அல்லது மைக்ரோசாட்லைட் உறுதியற்ற தன்மை (எம்.எஸ்.ஐ) (நிலையான நோயியல் சோதனைக்கு கூடுதலாக) சிகிச்சை பரிந்துரைகளை தீர்மானிக்க மட்டுமே நம்பியுள்ளன. புற்றுநோய் மரபணு அட்லஸ் (டி.சி.ஜி.ஏ) பெருங்குடல் புற்றுநோய் கூட்டுறவு மற்றும் நோயாளியின் உயிர்வாழ்வில் மரபணு வெளிப்பாடு அடிப்படையிலான நோயெதிர்ப்பு மறுமொழிகள், நுண்ணுயிர் சுயவிவரங்கள் மற்றும் கட்டி ஸ்ட்ரோமா ஆகியவற்றுக்கு இடையேயான தொடர்பு இல்லாததை ஆராய்ச்சியாளர்கள் குறிப்பிட்டுள்ளனர்.

ஆராய்ச்சி முன்னேறியுள்ளதால், புற்றுநோயின் புற்றுநோய் செல்லுலார், நோயெதிர்ப்பு, ஸ்ட்ரோமல் அல்லது நுண்ணுயிர் தன்மை உள்ளிட்ட முதன்மை பெருங்குடல் புற்றுநோயின் அளவு பண்புகள் மருத்துவ விளைவுகளுடன் கணிசமாக தொடர்புபடுத்தப்படுவதாக அறிவிக்கப்பட்டுள்ளன, ஆனால் அவற்றின் தொடர்புகள் நோயாளியின் விளைவுகளை எவ்வாறு பாதிக்கின்றன என்பதைப் பற்றிய வரையறுக்கப்பட்ட புரிதல் இன்னும் உள்ளது.
பினோடிபிக் சிக்கலான தன்மை மற்றும் விளைவுகளுக்கு இடையிலான உறவைப் பிரிக்க, கத்தாரில் உள்ள சிட்ரா இன்ஸ்டிடியூட் ஆப் மெடிக்கல் ரிசர்ச் ஆராய்ச்சியாளர்களின் குழு சமீபத்தில் ஒரு ஒருங்கிணைந்த மதிப்பெண்ணை (மைக்ரோஸ்கோர்) உருவாக்கி சரிபார்க்கிறது, இது நுண்ணுயிர் பண்புகள் மற்றும் நோயெதிர்ப்பு நிராகரிப்பு மாறிலிகளை (ஐ.சி.ஆர்) இணைப்பதன் மூலம் நல்ல உயிர்வாழும் விகிதங்களைக் கொண்ட நோயாளிகளின் குழுவை அடையாளம் காட்டுகிறது. முதன்மை பெருங்குடல் புற்றுநோயால் பாதிக்கப்பட்ட 348 நோயாளிகளிடமிருந்து புதிய உறைந்த மாதிரிகளின் விரிவான மரபணு பகுப்பாய்வை இந்த குழு நிகழ்த்தியது, இதில் கட்டிகளின் ஆர்.என்.ஏ வரிசைமுறை மற்றும் பொருந்திய ஆரோக்கியமான பெருங்குடல் திசு, முழு எக்ஸோம் வரிசைமுறை, ஆழமான டி-செல் ஏற்பி மற்றும் 16 எஸ் பாக்டீரியா ஆர்ஆர்என்ஏ மரபணு வரிசைமுறை ஆகியவை முழு கட்டி மரபணு வரிசைப்படுத்துதலால் கூடுதலாக நுண்ணுயிரிகளை வகைப்படுத்துகின்றன. இந்த ஆய்வு நேச்சர் மெடிசினில் "பெருங்குடல் புற்றுநோயின் ஒருங்கிணைந்த கட்டி, நோயெதிர்ப்பு மற்றும் நுண்ணுயிர் அட்லஸ்" என்று வெளியிடப்பட்டது.

இயற்கை மருத்துவத்தில் வெளியிடப்பட்ட கட்டுரை

AC-ICAM கண்ணோட்டம்

புதிய உறைந்த கட்டி மாதிரிகள் மற்றும் பொருந்திய அருகிலுள்ள ஆரோக்கியமான பெருங்குடல் திசு (கட்டி-இயல்பான ஜோடிகள்) நோயாளிகளிடமிருந்து, கால்களுக்கோலை நோய்க்குறியியல் நோயைக் கண்டறிதல் இல்லாமல், முறையான சிகிச்சை இல்லாமல் பகுப்பாய்வு செய்ய ஆராய்ச்சியாளர்கள் ஒரு ஆர்த்தோகனல் மரபணு தளத்தைப் பயன்படுத்தினர். முழு-எக்ஸோம் சீக்வென்சிங் (WES), ஆர்.என்.ஏ-சேக் தரவு தரக் கட்டுப்பாடு மற்றும் சேர்த்தல் அளவுகோல் ஸ்கிரீனிங் ஆகியவற்றின் அடிப்படையில், 348 நோயாளிகளிடமிருந்து மரபணு தரவு தக்கவைக்கப்பட்டு 4.6 ஆண்டுகள் சராசரி பின்தொடர்தலுடன் கீழ்நிலை பகுப்பாய்விற்கு பயன்படுத்தப்பட்டது. இந்த வள சிட்ரா-லும்க் ஏசி-ஐ.சி.ஏ.எம்: நோயெதிர்ப்பு-புற்றுநோய்-மைக்ரோபியோம் இடைவினைகளுக்கான வரைபடம் மற்றும் வழிகாட்டி (படம் 1) என்று ஆராய்ச்சி குழு பெயரிட்டது.

ஐ.சி.ஆரைப் பயன்படுத்தி மூலக்கூறு வகைப்பாடு

தொடர்ச்சியான புற்றுநோய் நோயெதிர்ப்புத் தடுப்பு (ஐ.சி.ஆர்) என அழைக்கப்படும் தொடர்ச்சியான புற்றுநோய் நோயெதிர்ப்பு நோய்த்தடுப்பு மருந்துகளுக்கான நோயெதிர்ப்பு மரபணு குறிப்பான்களின் ஒரு மட்டு தொகுப்பைக் கைப்பற்றி, ஆய்வுக் குழு ஐ.சி.ஆரை மெலனோமா, சிறுநீர்ப்பை புற்றுநோய் மற்றும் மார்பக புற்றுநோய் உள்ளிட்ட பல்வேறு புற்றுநோய் வகைகளை உள்ளடக்கிய 20-மரபணு பேனலில் ஒடுக்குவதன் மூலம் மேம்படுத்தியது. மார்பக புற்றுநோய் உட்பட பல்வேறு புற்றுநோய் வகைகளிலும் ஐ.சி.ஆர் நோயெதிர்ப்பு சிகிச்சை பதிலுடன் தொடர்புடையது.

முதலாவதாக, ஏசி-ஐ.சி.ஏ.எம் கூட்டணியின் ஐ.சி.ஆர் கையொப்பத்தை ஆராய்ச்சியாளர்கள் சரிபார்த்தனர், ஐ.சி.ஆர் மரபணு அடிப்படையிலான இணை வகைப்படுத்தல் அணுகுமுறையைப் பயன்படுத்தி, கூட்டணியை மூன்று கொத்துகள்/நோயெதிர்ப்பு துணை வகைகளாக வகைப்படுத்த: உயர் ஐ.சி.ஆர் (சூடான கட்டிகள்), நடுத்தர ஐ.சி.ஆர் மற்றும் குறைந்த ஐ.சி.ஆர் (குளிர் கட்டிகள்) (படம் 1 பி). பெருங்குடல் புற்றுநோயின் டிரான்ஸ்கிரிப்டோம் அடிப்படையிலான வகைப்பாடு, ஒருமித்த மூலக்கூறு துணை வகைகளுடன் (சிஎம்எஸ்) தொடர்புடைய நோயெதிர்ப்பு முன்கணிப்பை ஆராய்ச்சியாளர்கள் வகைப்படுத்தினர். CMS வகைகளில் CMS1/நோயெதிர்ப்பு, CMS2/CANONICAL, CMS3/வளர்சிதை மாற்ற மற்றும் CMS4/Mesenchymal ஆகியவை அடங்கும். ஐ.சி.ஆர் மதிப்பெண்கள் அனைத்து சிஎம்எஸ் துணை வகைகளிலும் சில புற்றுநோய் உயிரணு பாதைகளுடன் எதிர்மறையாக தொடர்புபடுத்தப்பட்டுள்ளன என்பதையும், சிஎம்எஸ் 4 கட்டிகளில் மட்டுமே நோயெதிர்ப்பு தடுப்பு மற்றும் ஸ்ட்ரோமல் தொடர்பான பாதைகளுடன் நேர்மறையான தொடர்புகள் காணப்பட்டன என்பதையும் பகுப்பாய்வு காட்டுகிறது.

அனைத்து சி.எம்.எஸ்ஸிலும், ஐ.சி.ஆர் உயர் நோயெதிர்ப்பு துணை வகைகளில் இயற்கை கொலையாளி (என்.கே) செல் மற்றும் டி செல் துணைக்குழுக்கள் மிக அதிகமாக இருந்தன, மற்ற லுகோசைட் துணைக்குழுக்களில் அதிக மாறுபாடு உள்ளது (படம் 1 சி) .இ.சி.ஆர் நோயெதிர்ப்பு துணை வகைகள் வெவ்வேறு ஓஎஸ் மற்றும் பிஎஃப்எஸ் ஆகியவற்றைக் கொண்டிருந்தன, ஐ.சி.ஆரில் அதிகப்படியான அதிகரிப்பு (படம் 1 டி), சருமத்தின் பங்கு.

படம் 1. ஏசி-ஐ.சி.ஏ.எம் ஆய்வு வடிவமைப்பு, நோயெதிர்ப்பு தொடர்பான மரபணு கையொப்பம், நோயெதிர்ப்பு மற்றும் மூலக்கூறு துணை வகைகள் மற்றும் உயிர்வாழ்வு.
ஐ.சி.ஆர் கட்டி-செறிவூட்டப்பட்ட, குளோனலி பெருக்கப்பட்ட டி செல்களைப் பிடிக்கிறது
கட்டி திசுக்களில் ஒரு சிறுபான்மை டி செல்கள் மட்டுமே கட்டி ஆன்டிஜென்களுக்கு (10%க்கும் குறைவாக) குறிப்பிட்டவை என்று தெரிவிக்கப்பட்டுள்ளது. ஆகையால், உள்-கட்டி டி செல்கள் பெரும்பாலானவை பார்வையாளர் டி செல்கள் (பார்வையாளர் டி செல்கள்) என குறிப்பிடப்படுகின்றன. உற்பத்தி டி.சி.ஆர்களைக் கொண்ட வழக்கமான டி கலங்களின் எண்ணிக்கையுடன் வலுவான தொடர்பு ஸ்ட்ரோமல் செல் மற்றும் லுகோசைட் துணை மக்கள்தொகைகளில் (ஆர்.என்.ஏ-சேக் கண்டறியப்பட்டது) காணப்பட்டது, இது டி செல் துணை மக்கள்தொகைகளை மதிப்பிடுவதற்குப் பயன்படுத்தப்படலாம் (படம் 2 ஏ). ஐ.சி.ஆர் கிளஸ்டர்களில் (ஒட்டுமொத்த மற்றும் சிஎம்எஸ் வகைப்பாடு), ஐ.சி.ஆர்-உயர் மற்றும் சி.எம்.எஸ் துணை வகை சி.எம்.எஸ் 1/நோயெதிர்ப்பு குழுக்களில் (படம் 2 சி), ஐ.சி.ஆர்-உயர் கட்டிகளின் மிக உயர்ந்த விகிதத்துடன் நோயெதிர்ப்பு SEQ டி.சி.ஆர்களின் மிக உயர்ந்த குளோனலிட்டி காணப்பட்டது. முழு டிரான்ஸ்கிரிப்டோம் (18,270 மரபணுக்கள்), ஆறு ஐ.சி.ஆர் மரபணுக்கள் (ஐ.எஃப்.என். கட்டி-பதிலளிக்கக்கூடிய சிடி 8+ குறிப்பான்களைப் பயன்படுத்தி காணப்பட்ட தொடர்புகளை விட இம்யூனோசெக் டி.சி.ஆர் குளோனலிட்டி பெரும்பாலான ஐ.சி.ஆர் மரபணுக்களுடன் மிகவும் வலுவாக தொடர்புடையது (படம் 2 எஃப் மற்றும் 2 ஜி). முடிவில், மேற்கண்ட பகுப்பாய்வு ஐ.சி.ஆர் கையொப்பம் கட்டி-செறிவூட்டப்பட்ட, குளோனலி பெருக்கப்பட்ட டி செல்கள் இருப்பதைக் கைப்பற்றுகிறது மற்றும் அதன் முன்கணிப்பு தாக்கங்களை விளக்கக்கூடும்.

படம் 2. டி.சி.ஆர் அளவீடுகள் மற்றும் நோயெதிர்ப்பு தொடர்பான மரபணுக்கள், நோயெதிர்ப்பு மற்றும் மூலக்கூறு துணை வகைகளுடன் தொடர்பு.
ஆரோக்கியமான மற்றும் பெருங்குடல் புற்றுநோய் திசுக்களில் நுண்ணுயிர் கலவை
246 நோயாளிகளிடமிருந்து பொருந்திய கட்டி மற்றும் ஆரோக்கியமான பெருங்குடல் திசுக்களிலிருந்து பிரித்தெடுக்கப்பட்ட டி.என்.ஏவைப் பயன்படுத்தி 16 எஸ் ஆர்ஆர்என்ஏ வரிசைமுறையை ஆராய்ச்சியாளர்கள் நிகழ்த்தினர் (படம் 3 ஏ). சரிபார்ப்புக்காக, ஆராய்ச்சியாளர்கள் கூடுதலாக 16 எஸ் ஆர்ஆர்என்ஏ மரபணு வரிசைமுறை தரவை கூடுதல் 42 கட்டி மாதிரிகளிலிருந்து பகுப்பாய்வு செய்தனர், இது பகுப்பாய்விற்கு கிடைக்காத சாதாரண டி.என்.ஏ உடன் பொருந்தவில்லை. முதலாவதாக, பொருந்திய கட்டிகளுக்கும் ஆரோக்கியமான பெருங்குடல் திசுக்களுக்கும் இடையில் தாவரங்களின் ஒப்பீட்டளவில் ஏராளமானவற்றை ஆராய்ச்சியாளர்கள் ஒப்பிட்டனர். ஆரோக்கியமான மாதிரிகளுடன் ஒப்பிடும்போது கட்டிகளில் க்ளோஸ்ட்ரிடியம் பெர்ஃப்ரிங்கன்ஸ் கணிசமாக அதிகரித்தது (படம் 3A-3D). கட்டி மற்றும் ஆரோக்கியமான மாதிரிகளுக்கு இடையில் ஆல்பா பன்முகத்தன்மை (ஒரு மாதிரியில் பன்முகத்தன்மை மற்றும் ஏராளமான உயிரினங்கள்) குறிப்பிடத்தக்க வேறுபாடு இல்லை, மேலும் ஐ.சி.ஆர்-குறைந்த கட்டிகளுடன் ஒப்பிடும்போது ஐ.சி.ஆர்-உயர் கட்டிகளில் நுண்ணுயிர் பன்முகத்தன்மையில் ஒரு சாதாரண குறைப்பு காணப்பட்டது.
நுண்ணுயிர் சுயவிவரங்களுக்கும் மருத்துவ விளைவுகளுக்கும் இடையில் மருத்துவ ரீதியாக தொடர்புடைய தொடர்புகளைக் கண்டறிய, ஆராய்ச்சியாளர்கள் உயிர்வாழ்வதைக் கணிக்கும் நுண்ணுயிர் அம்சங்களை அடையாளம் காண 16 எஸ் ஆர்ஆர்என்ஏ மரபணு வரிசைமுறை தரவைப் பயன்படுத்துவதை நோக்கமாகக் கொண்டனர். AC-ICAM246 இல், ஆராய்ச்சியாளர்கள் ஒரு OS COX பின்னடைவு மாதிரியை நடத்தினர், இது பூஜ்ஜியமற்ற குணகங்களுடன் (வேறுபட்ட இறப்பு அபாயத்துடன் தொடர்புடையது) 41 அம்சங்களைத் தேர்ந்தெடுத்தது, இது MBR வகைப்படுத்திகள் (படம் 3F) என அழைக்கப்படுகிறது.
இந்த பயிற்சி கோஹார்ட்டில் (ICAM246), குறைந்த MBR மதிப்பெண் (MBR <0, LOW MBR) கணிசமாக இறப்பு அபாயத்துடன் (85%) தொடர்புடையது. சுயாதீனமாக சரிபார்க்கப்பட்ட இரண்டு கூட்டாளிகளில் (ICAM42 மற்றும் TCGA-COAD) குறைந்த MBR (ஆபத்து) மற்றும் நீடித்த OS க்கு இடையிலான தொடர்பை ஆராய்ச்சியாளர்கள் உறுதிப்படுத்தினர். .

படம் 3. கட்டி மற்றும் ஆரோக்கியமான திசுக்களில் நுண்ணுயிர் மற்றும் ஐ.சி.ஆர் மற்றும் நோயாளியின் உயிர்வாழ்வுடனான உறவு.
முடிவு
இந்த ஆய்வில் பயன்படுத்தப்படும் பல-ஓமிக்ஸ் அணுகுமுறை பெருங்குடல் புற்றுநோயில் நோயெதிர்ப்பு மறுமொழியின் மூலக்கூறு கையொப்பத்தை முழுமையாகக் கண்டறிந்து பகுப்பாய்வு செய்கிறது மற்றும் நுண்ணுயிர் மற்றும் நோயெதிர்ப்பு மண்டலத்திற்கு இடையிலான தொடர்புகளை வெளிப்படுத்துகிறது. கட்டி மற்றும் ஆரோக்கியமான திசுக்களின் ஆழமான டி.சி.ஆர் வரிசைமுறை ஐ.சி.ஆரின் முன்கணிப்பு விளைவு கட்டி-செறிவூட்டப்பட்ட மற்றும் கட்டி ஆன்டிஜென்-குறிப்பிட்ட டி செல் குளோன்களைப் பிடிக்கும் திறன் காரணமாக இருக்கலாம் என்று தெரியவந்தது.

ஏசி-ஐ.சி.ஏ.எம் மாதிரிகளில் 16 எஸ் ஆர்ஆர்என்ஏ மரபணு வரிசைமுறையைப் பயன்படுத்தி கட்டி நுண்ணுயிர் கலவையை பகுப்பாய்வு செய்வதன் மூலம், குழு வலுவான முன்கணிப்பு மதிப்புடன் ஒரு நுண்ணுயிர் கையொப்பத்தை (எம்பிஆர் ஆபத்து மதிப்பெண்) அடையாளம் கண்டது. இந்த கையொப்பம் கட்டி மாதிரிகளிலிருந்து பெறப்பட்டிருந்தாலும், ஆரோக்கியமான பெருங்குடல் மற்றும் கட்டி MBR ஆபத்து மதிப்பெண் இடையே ஒரு வலுவான தொடர்பு இருந்தது, இந்த கையொப்பம் நோயாளிகளின் குடல் நுண்ணுயிர் கலவையை கைப்பற்றக்கூடும் என்று கூறுகிறது. ஐ.சி.ஆர் மற்றும் எம்.பி.ஆர் மதிப்பெண்களை இணைப்பதன் மூலம், பெருங்குடல் புற்றுநோயால் பாதிக்கப்பட்டவர்களில் உயிர்வாழ்வதைக் கணிக்கும் பல-மருத்துவ மாணவர் பயோமார்க்ஸரை அடையாளம் கண்டு சரிபார்க்க முடிந்தது. ஆய்வின் பல-மருத்துவ தரவுத்தொகுப்பு பெருங்குடல் புற்றுநோய் உயிரியலை நன்கு புரிந்துகொள்வதற்கும் தனிப்பயனாக்கப்பட்ட சிகிச்சை அணுகுமுறைகளைக் கண்டறிய உதவுவதற்கும் ஒரு ஆதாரத்தை வழங்குகிறது.

குறிப்பு:
ரோலண்ட்ஸ், ஜே., குப்பன், பி.ஜே.கே, அகமது, ஈ மற்றும் பலர். பெருங்குடல் புற்றுநோயின் ஒருங்கிணைந்த கட்டி, நோயெதிர்ப்பு மற்றும் நுண்ணுயிர் அட்லஸ். நாட் மெட் 29, 1273–1286 (2023).